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常染色质和异染色质的区别在于结构上是连续的，化学性质上没有区别，只是核酸的螺旋度(密度)不同。核酸是一种生物聚合物，是所有已知生命形式的重要组成部分。核酸是脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)的总称。

常染色质是染色质的松散聚集形式(由DNA、RNA和蛋白质组成)，大量存在于基因中，相应的片段通常处于转录活跃状态(但也不是必须的，即常染色质部分不一定都是高表达序列)。常染色质构成了核基因组中最活跃的部分。

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